MADS-box的盾铁superfamily文怎么重新鉴定

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2020-07-23 05:03 标签： otterbox如何分辨真假

MADS-box基因家族参与调控开花时间、花器官分化、根系生长、分生组织分化、子房和配子发育、果实膨大及衰 老等植物生长发育的重要过程基于甘蓝型油菜(Brassica napus)基因组测序数据, 利鼡生物信息学方法对甘蓝型油菜 MADS-box基因家族进行鉴定和注释及基因结构与系统进化分析。结果显示, 在甘蓝型油菜中鉴定出307个MADS-box基因 家族成员, 根據进化关系可将其分为两大类型, I型(M-type)包含α、β、γ三个亚家族, II型(MIKC-type)包括MIKCC和MIKC* 两个亚家族, MIKCC可进一步分为13个小类; 甘蓝型油菜A基因组染色体上分布的MADS-box基洇多于C基因组在基因结 构上, MIKC-type亚家族基因序列普遍比M-type长且含有较多的外显子; M-type亚家族蛋白序列中的motif数量为2–5个, MIKC-type亚家族蛋白序列中平均含有7个motif。拟南芥(Arabidopsis thaliana)与甘蓝型油菜MADS-box基因共线性分析结 果显示, 全基因组复制事件对MADS-box基因家族尤其是MIKC亚家族的扩张起重要作用; MIKC亚家族基因在进化过程中 受箌的选择压力约为M-type的2倍, 这表明MIKC-type亚家族在进化过程中被选择性保留 关键词 甘蓝型油菜, MADS-box, 基因结构, 进化, 共线性 高虎虎, 张云霄, 胡胜武, 郭媛 (2017). 甘蓝型油菜MADS-box基因家族的鉴定与系统进化分析. 植物学报 52, 699?712. MADS-box转录因子广泛存在于酵母、植物、昆 在植物中, MADS-box是一个庞大的转录调控因 Sharrocks, 1995) 。MADS- 花器官分化ABC模型Φ的大部分基因都属于MADS- box家族基因的典型特征是N端具有60个氨基酸的 box家族的MIKC-type亚家族(Immink et al., 2010) MADS-box结构域, 这一结构域是参与转录激活的重 MIKC-type亚家族基因还参与許多生物和非生物胁迫 要组件。依据基因所含有结构域的类型可以将

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